XC4000 計算統計学支援コンピュータシステム

2006年 1月に新しく導入されました。
HP ProLiant DL145 G2（AMD Opteron 2.6GHz 256CPU 640GB） MPIベースのスーパーコンピュータシステムです。

ハードウェア

計算ノード１

機械名：HP ProLiant DL145 G2
ノード数：96
C P U : AMD Opteron (2.6GHz) ｘ２ 96ノード 192CPU
メモリ: Total 4GB　96ノード　384GB

計算ノード２

機械名：HP ProLiant DL145 G2
ノード数：32
C P U : AMD Opteron (2.6GHz) ｘ２ 32ノード 64CPU
メモリ: Total 8GB　32ノード　276GB

サービスノード（ログイン）

ノード数：4
機械名：HP ProLiant DL385
C P U : AMD Opteron (2.6GHz) ｘ２ 4ノード 8CPU
メモリ: Total 8GB　4ノード　32GB

ソフトウェア

クラスタソフトウェア: XC System Software 以下を含む
- Linux Virtual Software
- SLURM
- SystemImager
- Pdsh
- Nagios
- SuperMon
開発用ソフトウェア:
- PGI Fortran C/C++
- Intel Fortran C/C++
- PathScale Fortran C/C++
- J2SE(TM)Development Kit
MPI2:
- HP MPI
数値演算ライブラリ:
- FFTW, SPRNG, AMD ACML
- NAG並列ライブラリ
開発環境支援ツール:
- PGIコンパイラ付属のデバッガ、プロファイラ
- HP MPI付属のプロファイラ
- GDBデバッガ
- pgrofプロファイラ
バッチジョブ管理:
- LSF

マニュアル

コンパイル、実行時の注意点

＜MPIでインテルフォートランを利用する場合の例＞

モジュールをロードする

利用可能なモジュールのリストは以下のコマンドで表示されます。
module avail
以下のコマンドを発行してください。(この場合MPIとifort/9.0）
module load mpi
module load ifort/9.0
ロードされたモジュールのリストは以下のコマンドで表示されます。
module list
モジュールをアンロードする場合は
module unload　モジュール名

コンパイル
mpif90 -o test test.f90
bsub 時に-o -e オプションを付ける、ファイル名にも注意する
(このオプションを付けないとファイルができませんのでご注意ください）
bsub -q q8 -n 8 -o test.out -e test.err mpirun -srun ./test
PATH について
.cshrc や.login ファイルで不適切なpath やmanpath を指定していることが原因となってコンパイルできない、man が表示できないことがあります。path manpath がない状態で計算等は可能です。またモジュールをロードするとそのモジュール内の内容のman が表示可能となります。
以上の点、前のマシンからホームを移行された方はご注意下さい。