統計数理研究所研究会 高次元のサンプリングとデータ解析からみたシミュレーション科学

統計数理研究所

東京都立川市(最寄り駅・多摩モノレール高松)

2012年 3月7日  (セミナー室3 D312A)

地図はここ


生体分子をはじめとする大規模なシミュレーションでは,複雑な「地形」を持つ高次元の空間を効率よくサンプリングし,揺らぎやダイナミクスを調べることが必要とされています.

また,シミュレーションの結果から縮約された情報を取り出す多変量解析手法,シミュレーションを実験データと直接比較する逆モンテカルロ法やデータ同化など,統計科学や機械学習とのかかわりも増してきています.

こうした手法の発展は「一定の形状に折りたたまれた分子」から「揺らぎ,ダイナミックに変形しながら機能を発揮する分子」という描像の変化とも呼応して,今後もさらに重要になってくることが予想されます.

この研究会では,この周辺で活躍されている若手・中堅の研究者の方々に最新の話題を提供して頂くことにしました.次年度の共同利用研究として申請中の「シミュレーション科学と統計科学の対話」の準備会も兼ねています.


10:00-11:30 (90分)
北尾 彰朗(東大,分子細胞生物学研究所)
タンパク質ソフトモードのサンプリングと相関解析

(90分昼食休憩)

13:00-14:00(60分)
萩田 克美(防衛大)
リバースモンテカルロ法と小角散乱データからの構造モデル構築

(15分休憩)

14:15-15:15(60分)
松永 康佑(理研,計算科学研究機構)
タンパク質の構造変化サンプリング - ストリング法とデータ同化

(15分休憩)

15:30-16:30(60分)
藤崎 弘士(日本医科大学)
経路積分を用いたパスサンプリング --- 量子ストリング法と Onsager-Machlup 作用汎関数法 ---

16:30-17:30(60分)
小山 洋平 (理研,生命システム研究センター)
原子間相互作用摂動解析による分子状態と重要な相互作用の同定


この研究会は,統計数理研究所共同研究 「マルコフ連鎖モンテカルロ法を用いたレアイベントサンプリング・ 数え上げ・仮想データ生成」の支援を受けています

参考 昨年度  「マルコフ連鎖モンテカルロ法とその周辺」 2011年@統計数理研究所


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