平成26(2014)年度 一般研究1実施報告書
課題番号 |
26−共研−1019 |
分野分類 |
統計数理研究所内分野分類 |
g |
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主要研究分野分類 |
3 |
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研究課題名 |
融合プロジェクト研究におけるNGSのデータ解析と結果の検証 |
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フリガナ 代表者氏名 |
タカダ トヨユキ 高田 豊行 |
ローマ字 |
Takada Toyoyuki |
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所属機関 |
国立遺伝学研究所 |
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所属部局 |
系統生物研究センター |
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職 名 |
助教 |
研究目的と成果(経過)の概要 |
情報・システム研究機構 新領域融合プロジェクト研究において、複数の研究機関と共同で最新ゲノム解析機器(NGS)を使用したマウスの遺伝子発現解析およびゲノム・エピゲノム解析を行っている。NGSから生産されたデータの解析には、強力なデータ処理能力と大容量の保存領域を持つスパコンが必要であり、結果を生物学的見地にたって推断するためには、統計学的、情報学的手法によるデータの高次解析が必要である。我々は普段、国立遺伝学研究所、DDBJが運営するスーパーコンピュータを使用してゲノム解析を行っているが、我々の使用可能なHDD領域が生産するゲノムデータに対して足りなくなる可能性があり、本アカウントに申請させていただいた。しかしながら、本アカウントが開設され、実際に統数研スパコンにより我々のNGSデータを解析する環境を整備する期間に、DDBJが運営するスーパーコンピュータにおける我々のHDD領域が増加されたため、本アカウントによる実際の解析を行うに至らなかった。 |
当該研究に関する情報源(論文発表、学会発表、プレプリント、ホームページ等) |
当該研究に関する情報源なし |
研究会を開催した場合は、テーマ・日時・場所・参加者数を記入してください。 |
研究会の開催なし |
研究参加者一覧 |
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氏名 |
所属機関 |
栗木 哲 |
統計数理研究所 |
近藤 伸二 |
国立極地研究所 |