平成262014)年度 一般研究1実施報告書

 

課題番号

26−共研−1019

分野分類

統計数理研究所内分野分類

g

主要研究分野分類

3

研究課題名

融合プロジェクト研究におけるNGSのデータ解析と結果の検証

フリガナ

代表者氏名

タカダ トヨユキ

高田 豊行

ローマ字

Takada Toyoyuki

所属機関

国立遺伝学研究所

所属部局

系統生物研究センター

職  名

助教

 

 

研究目的と成果(経過)の概要

情報・システム研究機構 新領域融合プロジェクト研究において、複数の研究機関と共同で最新ゲノム解析機器(NGS)を使用したマウスの遺伝子発現解析およびゲノム・エピゲノム解析を行っている。NGSから生産されたデータの解析には、強力なデータ処理能力と大容量の保存領域を持つスパコンが必要であり、結果を生物学的見地にたって推断するためには、統計学的、情報学的手法によるデータの高次解析が必要である。我々は普段、国立遺伝学研究所、DDBJが運営するスーパーコンピュータを使用してゲノム解析を行っているが、我々の使用可能なHDD領域が生産するゲノムデータに対して足りなくなる可能性があり、本アカウントに申請させていただいた。しかしながら、本アカウントが開設され、実際に統数研スパコンにより我々のNGSデータを解析する環境を整備する期間に、DDBJが運営するスーパーコンピュータにおける我々のHDD領域が増加されたため、本アカウントによる実際の解析を行うに至らなかった。

 

当該研究に関する情報源(論文発表、学会発表、プレプリント、ホームページ等)

当該研究に関する情報源なし

研究会を開催した場合は、テーマ・日時・場所・参加者数を記入してください。

研究会の開催なし

 

研究参加者一覧

氏名

所属機関

栗木 哲

統計数理研究所

近藤 伸二

国立極地研究所