平成292017)年度 一般研究2実施報告書

 

課題番号

29−共研−2058

分野分類

統計数理研究所内分野分類

h

主要研究分野分類

1

研究課題名

カーネル動的モード分解とその応用

フリガナ

代表者氏名

フクミズ ケンジ

福水 健次

ローマ字

Fukumizu Kenji

所属機関

統計数理研究所

所属部局

数理・推論研究系

職  名

教授

配分経費

研究費

40千円

旅 費

33千円

研究参加者数

2 人

 

 

研究目的と成果(経過)の概要


非線形力学をモード分解する方法として,カーネルDMDによるモード表現を考察し,カーネルDMDの性能向上と具体的問題への応用を目的とする.

本研究では特に,位相的データ解析により得られるタンパク質パーシステント図の時系列解析にカーネルDMDを適用することを課題とした.分子動力学シミュレーションにより得られたタンパク質1BDD(岐阜大・一宮尚志氏提供)のフォールディングに関するデータからパーシステント図の時系列を計算し,カーネルDMD法を適用してみたところ,フォールディングが完了して安定な状態に変化する時点の前後で,固有ベクトルが変化することが確認できた.このことは,フォールディングの問題にカーネルDMDを適用するアプローチが有望であることを示唆しており,今後,さらに大規模で複雑なシミュレーションデータに適用していく予定である.




 

当該研究に関する情報源(論文発表、学会発表、プレプリント、ホームページ等)

http://www.ism.ac.jp/~fukumizu/

研究会を開催した場合は、テーマ・日時・場所・参加者数を記入してください。

研究会の開催はなし.

 

研究参加者一覧

氏名

所属機関

紅林 亘

青森大学