平成28（2016）年度　共同利用登録実施報告書

課題番号	28−共研−11	分野分類		統計数理研究所内分野分類		f
				主要研究分野分類		3
研究課題名	微生物群集構造の解明に向けたメタゲノム配列に対する一括学習型自己組織化マップ解析
フリガナ 代表者氏名	アベ タカシ 阿部 貴志		ローマ字		Abe Takashi
所属機関	新潟大学
所属部局	工学部情報工学科
職　　名	准教授

研究目的と成果の概要

一括学習型自己組織化マップ（BLSOM）は教師なしのクラスタリングアルゴリズムであり，情報処理がしやすい3連や4連文字頻度に着目するだけで，他の予備知識なしに，ゲノム配列が生物系統別に自己組織化しており，配列の特徴付けを可能にしている．
メタゲノム配列からの効率的な知識発見を行うために，予備知識なしにゲノム配列断片を高精度に生物系統別に分離できるBLSOMを応用し，メタゲノム配列に対する生物系統推定ワークフローを開発してきた．
本研究では，開発したワークフローで使用するための全既知生物ゲノムを対象とした参照用BLSOMマップを作成する必要があり，貴研究所が保有する世界最大規模の共有メモリ型計算機を利用した大規模BLSOM解析を行う予定である．
今年度は，貴所スパコンシステム環境下での解析を実現するためのチューニングを行ってきたが，チューニングが予定通り上手く行かず，解析を行うことができなかった．継続的にチューニングを行い，国内有数のスパコンシステム上での解析の目処がついた段階で改めて，共同研究申請させて頂き，スパコンシステムを利用させて頂きたいと考えている．