平成21（2009）年度　共同利用登録実施報告書

課題番号	21−共研−16	分野分類		統計数理研究所内分野分類		f
				主要研究分野分類		3
研究課題名	新世代シーケンシングデータの解析手法の検討
フリガナ 代表者氏名	ワダ　ヤスヒコ 和田　康彦		ローマ字		Yasuhiko Wada
所属機関	佐賀大学
所属部局	農学部
職　　名	教授

研究目的と成果の概要

　新世代シーケンサーから生産される膨大なシーケンスデータを整理し、統計処理をする手法について、比較検討する。

　具体的には、ショートリードのシーケンスデータを参照配列にマッピングするMaqやSOAP2について、ウシやニワトリのゲノムに対しての性能について比較・検討する。

　今年度はMaqやSOAP2についてのインストールと既存のマウスやヒトでのショートリードのシーケンスデータをテストデータとして、検証を行った。

　また、ゲノムマッピングデータと全ゲノムのアノテーションデータを比較し、統計処理した結果を表示するシステムについて、プロトタイプの検討を行った。