平成26（2014）年度　一般研究１実施報告書

課題番号	26−共研−1023	分野分類		統計数理研究所内分野分類		h
				主要研究分野分類		3
研究課題名	タンパク質電子構造におけるデータマイニング研究
フリガナ 代表者氏名	サトウ フミトシ 佐藤 文俊		ローマ字		Sato Fumitoshi
所属機関	東京大学
所属部局	生産技術研究所
職　　名	教授

研究目的と成果（経過）の概要

　申請者らは、タンパク質など大規模分子の電子状態をありのまま計算する量子化学計算プログラムProteinDFの開発と実証計算を行っている。本研究では量子論に基づくタンパク質電子状態計算の自動化と、タンパク質ドメインに注目したデータマイニング技術の開発を目的とした。これはタンパク質の電子状態インフォマティクスともいえる。
　タンパク質電子状態計算のスループットを向上させるために、タンパク質モデリング環境の構築と電子状態計算における初期値自動作成法の研究開発を行った。タンパク質モデリングでは、PDBに登録された実験構造を元に、水素付加・構造緩和・溶媒処理計算を行い、必要な箇所には対イオンを付加するなどの一連の作業を自動化した。タンパク質電子状態計算における初期値は、QCLO法をベースに任意のフラグメントから初期値が構成できるように局在化軌道選別法を改良するとともに、プログラムの開発を行った。特殊なタンパク質構造に対応するなどの改良が必要であるが、タンパク質電子状態計算を継続しておこなうための基盤技術が構築できた。

当該研究に関する情報源（論文発表、学会発表、プレプリント、ホームページ等）

[1] 吉田洵也,平野敏行,佐藤文俊, "Study on QCLO method for canonical molecular orbital calculation of cofactor-containing protein", CBI学会, 2014 (東京)
[2] 佐藤文俊, "タンパク質量子化学計算がもたらす未来", 実験・理論科学と計算科学の融合シンポジウム, 2014 (岡山)

研究会を開催した場合は、テーマ・日時・場所・参加者数を記入してください。

研究会は開催しなかった。

研究参加者一覧
氏名	所属機関
王 笛申	東京大学
千葉 貢治	東京大学
平野 敏行	東京大学
松田 潤一	東京大学
吉田 洵也	東京大学