平成12（2000）年度　一般研究２実施報告書

課題番号	12−共研−2033			専門分類		7
研究課題名	分子系統樹推定の諸問題
フリガナ 代表者氏名	ハセガワ マサミ 長谷川 政美			ローマ字		Hasegawa, Masami
所属機関	統計数理研究所
所属部局	予測制御研究系
職　　名	教授
所在地
TEL				FAX
E-mail
URL
配分経費	研究費	0千円	旅　費		0千円		研究参加者数	17　人

研究目的と成果（経過）の概要

分子系統樹推定に関わる諸問題を研究した。
　ミトコンドリアのゲノム・データを用いて、哺乳類、特に真獣類の目間の系統関係、さらに羊膜類の
主要なグループ間の系統関係の解析を行なった。その結果、モグラ、トガリネズミなどの真食虫類とコ
ウモリなどの翼手類との近縁関係、カメ類と鳥類、ワニ類との近縁関係が明らかになった。その際、系
統樹推定が、仮定したモデルに対してどの程度ロバストかを検討し、モデルの改良を行なった。
SINE(Short Interspersed Repetitive Element)のflanking配列を解析し、このデータも系統樹推定に有用
であること、さらに分岐の順番だけでなく、分岐年代を推定するために役立つデータであることを示し
た。平成12年度には、偶蹄類とクジラ類との関係を議論するために、これらのデータを用いたが、そ
の後、クジラの内部系統を調べる目的で、もっと大規模な研究を進めている。

当該研究に関する情報源（論文発表、学会発表、プレプリント、ホームページ等）

(1)A close relationship of Chiroptera with Eulipotyphla(core Insectivora)suggested by four mitochondri
al genes.M.Onuma,Y.Cao,M.Hasegawa and S.Kusakabe(2000)Zool.Sci.,17:1327--1332
(2)Phylogenetic position of turtles among amniotes: evidence from mitochondrial and nuclear genes.
Y.Cao,M.D.Sorenson,Y.Kumazawa,D.P.Mindell and M.Hasegawa(2000)Gene,259:139--148
(3)Interordinal relationships and time-scale of eutherian evolution as inferred from mitochondrial genome
data.Y.Cao,M.Fujiwara,M.Nikaido,N.Okada and M.Hasegawa(2000)Gene,259:149--158
(4)Monophyletic origin of the order Chiroptera and its phylogenetic position among Mammalia inferred
from the complete mitochondrial DNA sequence of a Japanese megabat; Ryukyu flying fox(Pteropus
dasymallus).M.Nikaido,M.Harada,Y.Cao,M.Hasegawa and N.Okada(2000)J.Mol.Evol.,51:318
--328
(5)Phylogenetic relation of lungfish indicated by the amino acid sequence of myelin DM20.Y.Tohyam
a,T.Ichimiya,H.Kasama-Yoshida,Y.Cao,M.Hasegawa,H.Kojima,Y.Tamai,and T.Kurihara
(2000)Mol.Brain Res.,80:256--259
(6)Consistency of SINE insertion topology and flanking sequence tree:Quantifying relationshis among
cetartiodactyls.J.K.Lum,M.Nikaido,M.Shimamura,H.Shimodaira,A.M.Shedlock,N.Okada and
M.Hasegawa(2000)Mol.Biol.Evol.,17:1417--1424
(7)Appropriate likelihood ratio tests and marginal distributions for evolutionary tree models with
constraints on parameters.R.Ota,P.J.Waddell,M.Hasegawa,H.Shimodaira and H.Kishino(2000)
Mol.Biol.Evol.,17:798-803

研究会を開催した場合は、テーマ・日時・場所・参加者数を記入してください。

研究参加者一覧
氏名	所属機関
足立 淳	統計数理研究所
Austin, Christopher	統計数理研究所
岡田 典弘	東京工業大学
Ota, Rissa	総合研究大学院大学
岸野 洋久	東京大学
後藤 修	埼玉県立がんセンター研究所
Shedlock, Andrew	統計数理研究所
下平 英寿	統計数理研究所
徐 泰健	総合研究大学院大学
曹 纓	統計数理研究所
橋本 哲男	統計数理研究所
Martin, Bill	Univerisity of Duesseldorf
McClellan, David	統計数理研究所
Mindell, David	University of Michigan
Yang, Ziheng	University College London
Lum, Koji	統計数理研究所