平成28(2016)年度 共同利用登録実施報告書
| 課題番号 | 28−共研−16 | 分野分類 | 統計数理研究所内分野分類 | j | ||
| 主要研究分野分類 | 3 | |||||
| 研究課題名 | 軽量仮想環境を用いたゲノム解析フレームワークの構築 | |||||
| フリガナ 代表者氏名 | オオタ タツロウ 大田 達郎 | ローマ字 | Ohta Tazro | |||
| 所属機関 | 情報・システム研究機構 | |||||
| 所属部局 | ライフサイエンス統合データベースセンター | |||||
| 職 名 | 特任研究員 | |||||
| 研究目的と成果の概要 | 
| 本研究では、ゲノムデータ解析で用いられるソフトウェア群を組み合わせた多様なワークフローをパッケージングし、様々な計算機環境で実行できる形態にすることを目的とした。本研究の成果として、軽量仮想環境であるDockerおよび、Common Workflow Language を利用したポータブルなワークフローとその実行が可能となった。作成したワークフロー群は https://github.com/pitagora-galaxy/cwl にて公開している。 |