平成28(2016)年度 共同利用登録実施報告書
課題番号 |
28−共研−16 |
分野分類 |
統計数理研究所内分野分類 |
j |
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主要研究分野分類 |
3 |
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研究課題名 |
軽量仮想環境を用いたゲノム解析フレームワークの構築 |
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フリガナ 代表者氏名 |
オオタ タツロウ 大田 達郎 |
ローマ字 |
Ohta Tazro |
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所属機関 |
情報・システム研究機構 |
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所属部局 |
ライフサイエンス統合データベースセンター |
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職 名 |
特任研究員 |
研究目的と成果の概要 |
本研究では、ゲノムデータ解析で用いられるソフトウェア群を組み合わせた多様なワークフローをパッケージングし、様々な計算機環境で実行できる形態にすることを目的とした。本研究の成果として、軽量仮想環境であるDockerおよび、Common Workflow Language を利用したポータブルなワークフローとその実行が可能となった。作成したワークフロー群は https://github.com/pitagora-galaxy/cwl にて公開している。 |