平成282016)年度 共同利用登録実施報告書

 

課題番号

28−共研−16

分野分類

統計数理研究所内分野分類

j

主要研究分野分類

3

研究課題名

軽量仮想環境を用いたゲノム解析フレームワークの構築

フリガナ

代表者氏名

オオタ タツロウ

大田 達郎

ローマ字

Ohta Tazro

所属機関

情報・システム研究機構

所属部局

ライフサイエンス統合データベースセンター

職  名

特任研究員

 

 

研究目的と成果の概要

本研究では、ゲノムデータ解析で用いられるソフトウェア群を組み合わせた多様なワークフローをパッケージングし、様々な計算機環境で実行できる形態にすることを目的とした。本研究の成果として、軽量仮想環境であるDockerおよび、Common Workflow Language を利用したポータブルなワークフローとその実行が可能となった。作成したワークフロー群は https://github.com/pitagora-galaxy/cwl にて公開している。