平成26（2014）年度　一般研究２実施報告書

課題番号	26−共研−2069		分野分類			統計数理研究所内分野分類			g
						主要研究分野分類			3
研究課題名	古代ゲノム解析による日本列島の人類史推定
フリガナ 代表者氏名	オオタ ヒロキ 太田 博樹				ローマ字		Oota Hiroki
所属機関	北里大学
所属部局	医学部 解剖学
職　　名	准教授
配分経費	研究費	40千円		旅　費		24千円		研究参加者数		6　人

研究目的と成果（経過）の概要

　日本列島に住んでいる現代日本人がどのように形成されてきたかという問題は，一般社会にとっても高い関心事である．過去50年間に論争されてきた現代日本人の形成に関するモデルは二つに大別される．ひとつは，縄文時代人骨から弥生時代人骨への形態変化は大陸からの稲作文化の移入による環境変化への適応であるとする「小進化モデル」である．これに対し，大陸からのヒトの大量移住が現代本州日本人の形成に大きく影響しているとするのが「二重構造モデル」である．これまでの骨形態変異にもとづく研究やミトコンドリアのゲノム配列，タンパク多型などによる遺伝学的研究は，おおむね二重構造モデルを支持している。本研究では，古代人ゲノム配列データに加え，近年膨大に蓄積されつつある現代東アジア人の全ゲノム一塩基多型データ，配列データもあわせて用いることで，東アジアにおける現代日本人の形成の過程を明らかにすることを目標とする．
　本年度は，現代日本人，アイヌ，漢民族などのゲノム網羅的SNPデータをもちい、現代日本人形成に関する二つのモデルのどちらが支持されるか，移住，拡散，混血，人口動態について大枠のモデルを構築し，移住年代や混血率のような未知のパラメタをゲノム配列に沿う隠れマルコフモデル，階層ベイズモデルを用いて表現し，パラメタをマルコフ連鎖モンテカルロ法により推定した.こうしてゲノム情報にもとづく日本列島人類史の再構築を進めた.

当該研究に関する情報源（論文発表、学会発表、プレプリント、ホームページ等）

S. Nakagome, T. Sato, H. Ishida, T. Hanihara, T. Yamaguchi, R. Kimura, S. Mano*,
H. Oota* and The Asian DNA Repository Consortium

Model-based verification of hypotheses on the origin of modern Japanese revisited
by Bayesian inference based on genome-wide SNP data
Molecular Biology and Evolution (in press)（査読有）

T. Sato, S. Nakagome, C. Watanabe, K. Yamaguchi, A. Kawaguchi, K. Koganebuchi, K. Haneji, T. Yamaguchi, T. Hanihara, K. Yamamoto, H. Ishida, S. Mano, R. Kimura*, H. Oota*

Genome-Wide SNP Analysis Reveals Population Structure and Demographic History
of the Ryukyu Islanders in the Southern Part of the Japanese Archipelago
Molecular Biology and Evolution (2014) 31(11): 2929-40. doi: 10.1093 Pii: msu230.
[Epub ahead of print] （査読有）

http://www.med.kitasato-u.ac.jp/~anatomy-anthropology/oota_lab/index.php

研究会を開催した場合は、テーマ・日時・場所・参加者数を記入してください。

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研究参加者一覧
氏名	所属機関
小金渕 佳江	北里大学大学院
Savage, Patrick, Evan	東京芸術大学
中込滋樹	統計数理研究所
松前 ひろみ	北里大学
間野 修平	統計数理研究所