平成111999)年度 一般研究2実施報告書

 

課題番号

11−共研−2026

専門分類

2

研究課題名

マルコフ連鎖モンテカルロ法のアルゴリズムの開発と応用

フリガナ

代表者氏名

イバ ユキト

伊庭 幸人

ローマ字

Iba Yukito

所属機関

統計数理研究所

所属部局

予測制御研究系

職  名

助手

所在地

TEL

FAX

E-mail

URL

配分経費

研究費

0千円

旅 費

0千円

研究参加者数

6 人

 

 

 

研究目的と成果(経過)の概要

本年度の研究では、昨年度から継続して、格子たんぱくの設計(Inverse Folding)及び拡張
アンサンブルモンテカルロ法について研究した。今年度の成果は以下の通り。
(1)われわれの開発したアルゴリズム(MSOE)を2及び3次元の格子タンパク模型に適用して、
他の方法と比較し、有望な結果を得た。この結果は一流誌に掲載された。また関連する成果
を国際会議(ICCP5)で発表した。(2)設計のための規準を拡張し、また、従来提案されて
いたものの問題点を指摘した。また、デザイン方程式法による研究成果を国際会議(ICCP5)
で発表した。(3)拡張アンサンブルとマルコフ場による画像処理・空間統計との関連についての
予備的な議論を物理学会(3月)のシンポジウムで発表した。

 

当該研究に関する情報源(論文発表、学会発表、プレプリント、ホームページ等)

Chikenji,G.,Kikuchi,M.and Iba,Y.1999
Multi-Self-Overlap Ensemble for Protein folding:
Ground state search and Thermodynamics
Physical Review Letters 83(1999)1886-1889.
Tokita,K.,Kikuchi,M.and Iba,Y.2000
Dynamical Equation Approach for Protein Design
Proceedings of ICCP5 Prog.Theor.Phys.Suppl.138(2000)378-383.
Chikenji,G.and Kikuchi,M.and Iba,Y.2000
Multi-Selfoverlap-Ensemble Monte Carlo Method
for Lattice Proteins and Heteropolymers
Proceedings of ICCP5 Prog.Theor.Phys.Suppl.138(2000)404-405.

研究会を開催した場合は、テーマ・日時・場所・参加者数を記入してください。

 

研究参加者一覧

氏名

所属機関

菊池 誠

大阪大学

下平 英寿

統計数理研究所

田辺 國士

統計数理研究所

千見寺 浄慈

大阪大学大学院

時田 恵一郎

大阪大学