平成242012)年度 共同研究集会実施報告書

 

課題番号

24−共研−5002

分野分類

統計数理研究所内分野分類

a

主要研究分野分類

3

研究課題名

生物集団に関する遺伝データと集団遺伝学

フリガナ

代表者氏名

シマタニ ケンイチロウ

島谷 健一郎

ローマ字

Shimatani Kenichiro

所属機関

統計数理研究所

所属部局

モデリング研究系

職  名

准教授

配分経費

研究費

40千円

旅 費

365千円

研究参加者数

21 人

 

 

研究目的と成果(経過)の概要

2000年代に入り、野外の生物集団から大量の遺伝子情報を得られるようになっている。並行して、集団遺伝学で用いられる数学も年々高度になっている。両者は、統計科学に基づくサンプリング理論を通して融合されるべきである。本研究集会では、野外データ、集団遺伝学の数理、集団遺伝データの統計、の3者から参加者を募り、3者を融合させていく方向性について意見を交換する事を目的とした。
 研究集会は、
1.解説的講演
2.研究成果発表
3.途上にある研究の紹介
から構成した。
 当日のプログラムは以下のようになった。

8月30日(木)
13:00-13:20 趣旨説明+統計モデリング学習法に関して思うところ(島谷健一郎・統計数理研究所)
13:20-14:10 遺伝子系図学 (coalescent) とデータ解析(手島康介・九州大学)
14:20-15:10ゲノム情報を用いた集団の歴史の推定:霊長類や植物の例(長田直樹・遺伝研)
15:30-16;20 遺伝子頻度データを一般化線形モデルの枠組みで解析できるか(小泉逸郎・北海道大)
16:20-17:10 植物の季節性を司る温度応答モデルとその種内変異の推定 〜北方針葉樹トドマツの低温馴化タイミングにおける標高変異を用いて〜(石塚航・東京大)
17:10-18:00 野生植物集団の遺伝構造とエピジェネティック構造(荒木希和子・京都大)

8月31日(金)
9:10-10:00 日本人集団においてDPB1*0401に作用した正の自然選択(大橋順・筑波大)
10:10-11:00 Archaeal beta diversity pattern on geochemical gradients and material cycles 古細菌のベータ多様性パターンと物質循環(小谷野仁・京都大)
11:10-12:00  Kernel Approximate Bayesian Computationによる祖先推定(中込滋樹・統数研)
13:00-13:50 ヒト集団間の相互作用(木村亮介・琉球大)

その後16 時頃まで、参加者の中から以下のような話題提供をしていただいた。

ショウジョウバエの暗闇適応に関わる遺伝子の同定にむけて(井筒弥那子・京都大)
チンパンジー苦味受容体の遺伝的多様性と生態地理(早川卓志・京都大)
自然淘汰の影響下にある遺伝子系図のサンプリング(河合洋介・立命館大)
集団におけるエピスタシスの抽出に向けたリソースと情報の公開(権藤洋一・理研バイオリソースセンター)
標高万能植物ミヤマハタザオの環境適応遺伝子の探索(平尾章・筑波大菅平センター)
真社会性ハダカデバネズミのコロニー内の集団多様性と種内の集団多様性(三浦恭子・慶応大)
及び総合討論

 

当該研究に関する情報源(論文発表、学会発表、プレプリント、ホームページ等)

特になし

 

研究参加者一覧

氏名

所属機関

荒木 希和子

京都大学

池田 啓

独立行政法人 国立科学博物館

石塚 航

東京大学大学院

井筒 弥那子

京都大学

大橋 順

筑波大学

長田 直樹

国立遺伝学研究所

恩田 義彦

筑波大学

岸野 洋久

東京大学

木村 亮介

琉球大学

小泉 逸郎

北海道大学

小谷野 仁

京都大学

佐藤 丈寛

琉球大学

下野 嘉子

京都大学

田中 健太

筑波大学

手島 康介

九州大学

手塚 あゆみ

東北大学 大学院

沼倉 健介

東北大学

間野 修平

統計数理研究所

森長 真一

東京大学

山崎 清

大阪大学